Stormrise kent een eenvoudig maar effectief besturingssysteem, puur bedoeld voor de spelcomputers. Deze zogenaamde Whip Select-besturing zorgt ervoor dat je met een beweging vanaf elke plek iedere groep eenheden op het gehele slagveld kunt selecteren, door met jouw rechterstick in de juiste richting te bewegen. Met één korte Flick kun je dichtbijgelegen troepen selecteren.
In tegenstelling tot vergelijkbare strategiegames, bekijk je Stormrise vanuit een hoog derdepersoonsperspectief, waarbij je met de linkerstick opdracht geeft aan jouw eenheden. De actie speelt zich daarnaast zowel boven als onder de grond af, waardoor je bijvoorbeeld verrassingsaanvallen kunt plegen via de uitgebreide ondergrondse gangenstelsels die de omgevingen rijk zijn.
